El problema de plegamiento de proteínas de DeepMind resuelve el mayor problema de la biología gracias a la IA

Las proteínas están formadas por cadenas de aminoácidos que se doblan y acoplan entre sí espontáneamente, en un proceso llamado plegamiento de proteínas, para formar una estructura tridimensional (3D) relacionada con la función biológica de la proteína. Uno de los desafíos más grandes de la biología molecular, es el problema del plegamiento de las proteínas el cual consiste en entender cómo la secuencia de aminoácidos determina la estructura tridimensional. 

A partir de esto, la compañía DeepMind ha creado Alphafold, un programa de inteligencia artificial que desde el año 2016 se ha encargado de realizar predicciones de la estructura de las proteínas mediante Deep learning, programa destacado por predecir estructuras para las que no existían modelos previos.

AlphaFold ha sido entrenado con más de 170.000 proteínas de los depósitos públicos de secuencias y estructuras de proteínas, además de esto, empleó entre cien y doscientas unidades de procesamiento gráfico (GPU) por lo que necesita unos días para predecir una estructura. 

Su primer lanzamiento que fue el 22 de julio de 2021, cubre más de 350.000 estructuras, incluido el proteoma humano (todas las 20.000 proteínas conocidas expresadas en el cuerpo humano), junto con los proteomas de 20 organismos adicionales importantes para la investigación biológica, incluida la levadura, la mosca de la fruta y el ratón. 

Este lanzamiento amplió drásticamente el conocimiento de las estructuras de proteínas y duplicó el número de estructuras de proteínas humanas de alta precisión disponibles para los científicos de todo el mundo. Ahora, su último lanzamiento, anunciado el 28 de julio de 2022, amplía esta base de datos de casi 1 millón de estructuras a más de 200 millones de estructuras, incluidas casi todas las proteínas catalogadas conocidas por la ciencia, acelerando así el progreso en muchas áreas de investigación que son importantes para la sociedad.

Puedes aclarar más de tus inquietudes en este tema con este video https://www.youtube.com/watch?v=gg7WjuFs8F4&t=210s 

Y para mayor información sobre el tema puedes consultar la página oficial de Alphafold: https://www.deepmind.com/research/highlighted-research/alphafold

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